L’ACM s’organise, selon l’enseignement du Nouveau Testament, de façon collégiale et non hiérarchique.
Une « équipe d’anciens » conduit spirituellement l’église. Ils constituent les pasteurs de l’Assemblée.
Dans le domaine pratique, une « équipe diaconale » coordonne les services et les diverses activités.
Les dirigeants de l’ACM construisent entre eux des relations amicales et rendent volontairement et réciproquement des comptes aux ministères de Nouvelles Frontières France et au Conseil National des Evangéliques de France.
Les anciens (Farid et Pierre)